I Crocodilia gruppen er 23 arter af reptiler opdelt i fire primære grupper. Disse inkluderer alligatorer, som er hjemmehørende i USA og Kina; krokodiller, fundet i USA, tropisk Afrika, Asien og Australien; og deres fætre caimans og gharials, som lever i Sydamerika og Indien henholdsvis. Disse er vandreptiler, der også kan trives på land. Denne alsidighed gør dem særligt farlige for bytte både i og uden for vandet. Særlig for denne gruppe er en semi-sprawl gangart, der tillader dem at bevæge sig hurtigt og galopere over land.
Squamata
Kendt som ormeøgle gruppen, har Squamata næsten 8.000 forskellige arter af firben og slanger. Det er den mest arts-tætte reptilgruppe og udgør stort set alle reptiler. Denne gruppe inkluderer leguaner, kameleoner og gekkoer. Firben har knæk-haler, der regenererer. Slange arter inkluderer kvælerslanger, boas, kobras og hugorme. Disse slanger har kvadrate knogler i deres mund, som tillader dem at spise bytte meget større end sig selv.
Testudines
Der er 300 arter af skildpadder og skildpadder i Testudines gruppen. Denne gruppe har nogle af de ældste arter af levende reptiler. Skildpadder og skildpadder troes ofte at være det samme, men de er faktisk meget forskellige. Skildpadder har svømmefødder og lever i vandet, mens skildpadder tilbringer deres liv mest på land og kan overleve i tørre områder. De har til fælles, at de lægger æg, ikke har tænder, og de fleste er altædende.
Sphendonitia
Dette er den mindste orden af reptiler og indeholder kun to sjældne arter, tuataras. På grund af dette indeholder den lille gruppe den eneste truede reptilart. Tuataras ser ud som firben og lever kun i New Zealand. Tuatara er det eneste reptil, der ligner forhistoriske firben. På grund af dette omtales det ofte som en "levende fossile."
