Mikroorganismer, herunder bakterier, archaea, svampe og protozoer, giver mange fordele til levende væsener:
- Næringstofforcirkulation og nedbrydning.
- Kvælstoffixering for plantevækst.
- Hjælp til bestøvning.
- Antibiotikaproduktion.
- Biobrændstofproduktion.
- Industrielle processer som gæring og farmaceutisk fremstilling.
- Symbiotiske relationer, herunder tarmbakterier og mykorrhiza-svampe.
- Spildevandsrensning.
- Biologisk skadedyrbekæmpelse.
- Bioremediation af forurenede miljøer.
Overordnet spiller mikroorganismer diverse og afgørende roller i at understøtte levende væsener og opretholde balancerede økosystemer.