Kæledyr
Teknisk set et pelsmønster, har "merle"-genen en betydelig indflydelse på hundens farve: sorte pels bliver "blå" merles, blå pels bliver blå eller lilla merles, chokolade pels bliver "røde" merles osv. Udover bleknings-effekten, som mønsteret skaber, er "dobbelt" merles (to merle-forældre) hvide hunde med farvede plettmer. Merle er et komplekst emne i pelsgenetik med nogle forbundne komplikationer.
Merle-genen forårsager en uregelmæssig udtyndning af hundens synlige pelsfarve. Uregelmæssigheden producerer, hvad der ser ud som en række mørke farvepletter på et lyst farvet felt. Ifølge Shetland Sheepdog-avler Sue Ann Bowling: "blegningen virker primært på det sorte pigment i pelsen, så enhver brun farve på ansigtet forbliver uændret." Fordi gener for lever/chokolade, blå udtyndning og selv sabel pelsfarve alle ligger på samme position på kromosomestrengen, kaldet et "locus", påvirkes de alle af merle-modifiereren. Hunden med merle-pels kan også have blå øjne eller øjne, der er både blå og brune ("split" eller "marbled"), på grund af genens effekt på øjenpigmentet.
I virkeligheden er den velkendte "blå" merle en hund med sort pels, der er modificeret af merle-genen. Denne forkert benævnelse har ført til kreative navne som "slate merle" for hunde med blågrå grundfarve. Disse hunde har mørkeblå mærkater på et lyseblåt felt.
Den brede offentlighed er mindre fortrolig med merles i andre farver end blå. Disse farver inkluderer "røde" merles (chokolade/lever mærkater på brunt felt), "lilla" merles (blyg rød på lysebrunt felt) og sabel merle. Interessant er, at langhårede sabel merles ofte er "kryptiske" merles, upåviselige ved almindelig observation, fordi sabel allerede er en skygget farve. Noget pletmønster på ryggen og spidsen af hundens ører kan afsløre det som sabel merle for den kundige observatør.
Merle-genen er dominant over andre pelsfarver og mønstre. På grund af sin natur som udtyndende faktor skaber parning af to merles en hvid hund med små farvepletter. Disse hunde, kaldet "dobbelt merles", er typisk usunde. Sue Ann Bowling siger, at dobbelt merles "ofte er døve eller blinde og ofte med andre fysiske problemer. Nogle [dobbelt merle] valpe fødes helt uden øjne." Etiske avlere vil ikke avle dobbelt merles til salg til offentligheden.
Mange hyrderacers har merle-pels tilladt af deres standarder: collies (rå og glat), border collies, pembroke og cardigan welsh corgis, louisiana catahoula leopard hunde og australiske shepherds er blandt dem. Dog har merle-pels også dukked op i uventede racers, som dachshunds (hvor det kaldes "dapple"), chihuahuas og papillons.
Selvom merle-genen har et unikt udtryk, producerer nogle andre pletmønstre lignende effekter. AKC Glossary beskriver også Harlequin ("pletfarvet", typisk beskrive store danske hunde), pletmønster ("mønster af mørke runde pletter på lyst baggrund") og roan ("fin blanding af farvede hår med hvide hår"). Nogle hunde med roan-mærkater har også andre farvepletter, som ses i tyske kortårige forstehunde og australiske kvægehunder. Sådanne hunde kan nogle gange fejlaktigt tages for merles.