Mojave-ørkenen bevarer diverse plante- og dyreliv, men mange arter er truede af uddøen på grund af habitattab, klimaforandringer og andre pres. Nogle af de mest truede arter inkluderer:
- Ørken-skildpadde: Truet af habitattab, klimaforandringer og ulovlig indsamling.
- Mohave-markmus: En liten gnager truet af habitattab, klimaforandringer og ikke-hjemmehørende rovfugle.
- Gila-øgle: En giftig øgle truet af habitattab, klimaforandringer og ulovlig indsamling.
- Båndet Gila-øgle: Ligner trusler fra habitatforringelse og ulovlig handel.
- Fladhale-hornet øgle: Truet af habitattab, klimaforandringer og prædation af ikke-hjemmehørende arter.
- Mojave-frynse-tået øgle: En lille øgle truet af habitattab, klimaforandringer and invasive rovfugle.
- Panamint-alligator-øgle: Truet af habitattab, klimaforandringer og ikke-hjemmehørende prædation.
- Vestlig jordugle: Truet af habitattab, klimaforandringer og prædation af ikke-hjemmehørende arter.
- Phainopepla: En sangfugl truet af habitattab, klimaforandringer og konkurrence fra ikke-hjemmehørende arter.
Bevaringsindsatser er i gang, men yderligere handling er nødvendig for at sikre disse arts overlevelse.