Hvidhovedet ørne står over for:
- Tab af levesteder fra skov- og sumprydning
- Klimaforandringer, der påvirker føde og træk
- Vandforurening fra pesticider og tungmetaller
- Blyforgiftning fra ammunition og fiskegrej
- Menneskelig forstyrrelse nær reder
- Kollisioner med elledninger, vindmøller og bygninger
- Ulovlig jagt og forfølgelse
Bevaringsindsatser inkluderer beskyttelse af levesteder, reguleringer, forurenskontrol, uddannelse og overvågning.