Højt truede pingvinarter omfatter:
- Nordlig rockhopperpingvin: Kritisk truet; omkring 4.000 ynglepar.
- Afrikansk pingvin: Truet; omkring 19.000 ynglepar.
- Kamtsjathatpingvin: Truet; omkring 1,2 millioner ynglepar.
- Snarespingvin: Sårbar; omkring 30.000 ynglepar.
- Fiordlandpingvin: Sårbar; omkring 150.000 ynglepar.
Store trusler omfatter overfiskeri, klimaforandringer, tab af levesteder, kommercielt fiskeri og introducerede arter.