De fleste fiskearter har ikke tydelige eksterne kønskenntetegn, og nogle er endda kønnskiftende. I arter med separate køn kan hanner og hunner nogle gange skelnes ved:
- Farvelægning: Hanner er ofte mere farverige end hunner, som ses hos mange guppyer og sværdhaler.
- Kropsform: Seksuell dimorfisme kan medføre, at hanner og hunner har forskellige silhuetter. Han kampffisk har f.eks. typisk længere, mere flydende fletter end hunner.
- Kønssåbninger: Hos levefødende som platyer og sværdhaler har hanner en modificeret analfin kaldet gonopodium, mens hunner har en anden åbning. Hos æglæggere er hunnens kønssåbning normalt større og rundere.
- Adfærd: Under gydeperioden kan hanner udføre parningsdanser, bygge reder eller vise territoriale adfærd for at tiltrække hunner.
Fordi disse træk varierer meget mellem arter, er den mest pålidelige metode at konsultere artspecifikke guider eller en akvarkundig.