Filippinerne bevarer en række hjemmehørende sødvandsfisk, herunder flere barb-arter. Regnbueørred er også blevet introduceret til kommercielle og rekreative formål.
Hjemmehørende arter inkluderer
- Plettet barb (Puntius binotatus): Findes i floder, bække og bjergsøer.
- Hjemmehørende barb (Puntius sp.): Kendt lokalt som "dalag", findes i bjergbække.
- Mindoro barb (Puntius sealei): Endemisk for Mindoro-øen.
- Palawan barb (Puntius palata): Findes i Palawans floder og bække.
- Malabar rød barb (Puntius filamentosus): Introduceret og fundet i sødvandsforekomster.
- Rødhalet borstet barb (Puntius erythromicron): Hjemmehørende i filippinske floder og bække.
Andre hjemmehørende sødvandsarter inkluderer guldfisk-gurami, plettet knivfisk, stor gurami og vilde skalar-populationer.
