Selvom hvidhaijer er topprædatorer, har de naturlige fjender og trusler:
- Andre hvidhaijer: De er kendt for at være kannibaliske og kan prædere på mindre af deres egen art.
- Sværdhvaler (orcas): Sværdhvaler er topprædatorer, der jagter og dræber hvidhaijer.
- Elefantsæler: Disse store havpattedyr kan forsvare sig og har været kendt for at dræbe hvidhaijer.
- Søløver: Bevægelige søløver kan nogle gange undslippe og skade hvidhaijer.
- Pukkelhvaler: Disse magtfulde hvaler er observeret ved at bruge deres hale til at slå eller stønne hvidhaijer.
Mennesker udgør også en betydelig trussel gennem fiskeri, bifangst og habitatforringelse.
