Kæledyr
Betydelige klimaændringer under den sene mioceen og tidlige pliocæn påvirkede havtemperaturer og cirkulationsmønstre, hvilket påvirkede fordelingen og rigdommen af megalodons bytte, såsom store marine pattedyr og fisk.
Fremkomsten af andre store marine rovdyr, inklusive spækhuggere og store hvide hajer, kan have øget konkurrencen om føde. Nogle forskere antyder, at spækhuggere kan have bydet på unge megalodoner.
Ændringer i rigdom og mangfoldighed af byttearter kunne have kaskadeeffekter på megalodons fødeforsyning. Nedgang i visse hvalbestande kunne have reduceret fødetilgængelighed.
Ændringer i havniveau og kystmiljøer kan have resulteret i tab af egnede levesteder, især yngle- og opvækstområder, hvilket reducerede reproduktiv succes og overlevelsesrater.
Megalodons store størrelse og specialiserede fødevaner kan have gjort den sårbar over for genetiske mutationer og reduceret tilpasningsevne til skiftende miljøforhold.
Disse faktorer sandsynligvis virkede i kombination snarere end nogen enkelt faktor var alene ansvarlig. De nøjagtige mekanismer og relative bidrag forbliver emner for løbende videnskabelig forskning og debat.