Der er flere ulemper forbundet med at spise hajkød:
- Kviksølvophobning: Som toppredatorer ophober hajer kviksølv, som kan forårsage neurologiske skader, især hos udviklende fostre og små børn.
- Ciguatera fiskeforgiftning: Nogle store hajarter kan bære ciguatera-toxin, der forårsager gastrointestinale og neurologiske symptomer.
- Overfiskeri og bæredygtighed: Mange hajarter er i tilbagegang på grund af overfiskeri og langsomme reproduktionsrater.
- Høje niveauer af urinstof: Hajkød indeholder ofte høje niveauer af urinstof, som kan belaste nyrerne.
Reguleringsmyndigheder i forskellige lande anbefaler at begrænse eller undgå visse hajarter, især for gravide kvinder og små børn.