Kæledyr Liv
Tab af levesteder: Lower Keys-kaninens habitat går hurtigt tabt på grund af menneskelige aktiviteter såsom byudvikling, landbrug og turisme. Dette tab af levesteder fragmenterer kaninens befolkning, hvilket gør den mere sårbar over for prædation og sygdom.
Jagt: Lower Keys-kaninen blev engang jaget for mad og pels, og selvom den nu er officielt beskyttet, forekommer der stadig en vis ulovlig jagt.
Sygdom: Lower Keys-kaninen er modtagelig for en række sygdomme, herunder tularæmi, som er en bakteriel sygdom, der kan være dødelig for kaniner. Tularemia spredes af flåter, og Lower Keys-kaninens levested er hjemsted for mange flåter.
Predation: Lower Keys-kaninen bliver forgrebet af en række forskellige dyr, herunder slanger, ugler og høge. Indførelsen af ikke-indfødte rovdyr, såsom katte, har også bidraget til nedgangen for Lower Keys-kaninen.
Klimaændringer: Klimaændringer er også en stor trussel mod Lower Keys-kaninen. Stigende havniveauer oversvømmer kaninens levested, og mere ekstreme vejrbegivenheder, såsom orkaner, ødelægger dens føde og husly.