Præriehunde står over for flere trusler, der har ført til befolkningsnedgang:
- Tab af levesteder: Kolonier er blevet reduceret af landbrug, byudvikling og ændringer i arealanvendelse.
- Pesticider: Gnaverkontrolkemikalier kan forgifte præriehunde.
- Sygdomme: Skovpest, tularemia og hundestød kan sprede sig gennem kolonier.
- Jagt: Nogle områder tillader jagt for sport eller beskyttelse af husdyr.
- Rovdyr: Coyoter, ulve, ræve og rovfugle jager præriehunde.
Flere præriehundearter er opført som truet eller udryddelsestruet under truede arter-loven. Bevaringsindsatser er i gang for at beskytte deres levesteder og håndtere trusler.
