Mississippi er hjemsted for et mangfoldigt dyreliv, herunder mange arter hjemmehørende i staten:
- Mississippi Gopher Frø — endemisk for Mississippi og federaltruet
- Flatwoods Salamander — fundet i furuskove i Mississippi og Alabama
- Pine Woods Slange — fundet i furuskove i Mississippi og andre sydøstlige stater
- Østlig Diamantrystelslange — en af verdens største rystelslanger
- Mississippi Glente — en mellemstor glente med gråt krop og hvid hoved
- Rødhættet Spætte — en lille sort-hvid spætte med en rød plet på hovedet
- Bachmans Spurv — fundet på åbne marker og i furuskove
- Østlig Blåfugl — en lille blåfugl med rustrød bryst
- Amerikansk Alligator — fundet i sumpe, floder og søer
- Golf Stør — en stor, forhistorisk udseende fisk fundet i Mexikogolfen og dens sidedale
Dette er blot nogle eksempler på de mange dyr, der er hjemmehørende i Mississippi.