Selektiv avl kan medføre flere potentielle omkostninger:
- Reduceret genetisk mangfoldighed: Små paringspuljer sænker variabilitet og øger sårbarhed over for sygdom og miljøændringer.
- Indavl og sundhedsproblemer: Parning af nære slægtninge øger risikoen for genetiske lidelser.
- Tab af andre træk: Fokus på specifikke træk kan få værdifulde egenskaber som sygdomsresistens til at falde.
- Ethiske bekymringer: Praksis som aflivning eller genetisk modificering kan kompromittere dyrevelfærd.
- Begrænset tilpasning: Dyr tilpasset specifikke forhold kan kæmpe i skiftende miljøer.
- Tab af traditionel viden og biodiversitet: Industrielt avl kan underminere lokale racer og afgrødemangfoldighed.
- Økonomiske omkostninger: Avlsprogrammer kræver betydelige investeringer i infrastruktur, teknologi og ekspertise.
Omkostninger varierer efter organisme, omfang og den etik og videnskab, der anvendes.
