De vigtigste årsager til, at havørnen blev truet, er:
- Jagt og skydning: I det 18. og 19. århundrede blev de ofte betragtet som trusler mod husdyr og landbrug og blev rutinemæssigt dræbt.
- Pesticidbrug: Den udbredte brug af DDT forårsagede, at æggeskaller blev tynde og knakkede let, hvilket førte til reproduktiv tilbagegang.
- Habitat tab og ødelæggelse: Skovhugst, urbanisering og landbrug ødelagde og ændrede deres naturlige habitater.
På grund af disse faktorer faldt havørnebestanden drastisk, og arten blev klassificeret som truet i 1970'erne.
