Kæledyr
Hvidhovedede havørne kan dø af sygdomme som fugleinfluenza, West Nile virus og blyforgiftning. Æg og unge ørne kan byttes af hornugler og kongeørne. Voksne sjældent byttes, men kan dræbes af større rovdyr. Kollisioner med elledninger og vindmøller samt jagt, fangst og habitattab forårsaget af mennesker dræber også hvidhovedede havørne.