Kæledyr
Jaguarer aftager på grund af ulovlig jagt for deres pels og kropsdele, som er værdifulde på det sorte marked. Habitattab og fragmentering fra skovrydning, landbrug, infrastruktur og byudvikling reducerer det område, jaguarer har brug for at strejfe, og forstyrrer parnings- og fødemønstre.
Menneske-vildt konflikter spiller også en rolle, da jaguarer, der bytter på husdyr, kan blive dræbt af landmænd og ranchere. Klimaforandringer ændrer habitater og byttetilgængelighed, mens relativt lav genetisk diversitet gør jaguarer mere sårbare over for sygdomme og miljømæssige ændringer.