Kæledyr
Disse flagermus afhænger af huler og klippekløfter til redepladser og overvintring. Menneskelige aktiviteter som minedrift, skovhugning og urbanisering forstyrrer eller ødelægger ofte disse kritiske habitater.
Landbrugs- og skadedyrbekæmpelseskemikalier kan akkumulere i flagermusens legemer, forårsage reproduktionsproblemer, misdannelser og død.
Hvidnosesygdom, en dødelig svampesygdom, har dræbt millioner af flagermus i Nordamerika. Selvom den endnu ikke er påvist hos Townsends storørede flagermus, forbliver det en alvorlig trussel.
Flagermus jages nogle gange for pels eller samles som kuriositeter, hvilket kan ødelægge lokale populationer.
Skiftende klima kan forstyrre overvintring, reducere egne redepladser og ændre fordelingen af insekt-bytte.
Beskyttelse af tilbageværende habitater, reduktion af pesticidanvendelse og forebyggelse af sygdomsspredning er essentielle trin for at hjælpe denne art med at overleve.