Kæledyr
Kejser-tamarinaber er relativt små og smidige primater, hvilket hjælper dem med at undgå mange rovdyr. Imidlertid er de stadig sårbare over for nogle trusler i deres Amazonas regnskovs levested:
Rovfugle: Høge, ørne og ugler er kendt for at jage tamarinaber.
Slanger: Større slanger, såsom boaer og anacondaer, kan udgøre en trussel.
Små katte: Ocelots og andre små vilde katte kan jage tamarinaber.
Større pattedyr: Selv større pattedyr som jaguare og pumaer kunne potentielt jage tamarinaber, selvom de sandsynligvis vil gå efter større bytte.
Det er vigtigt at huske, at kejser-tamariner er et relativt lille bytteemne og derfor ikke er en primær fødekilde for mange rovdyr. Deres smidighed og sociale adfærd, som inkluderer at leve i grupper, hjælper dem med at overleve og undgå at blive jaget af disse rovdyr.