Kæledyr
Saltvandsfisk og invertebrat-skabninger, såsom svamp og koraller, kræver et stabilt og forurening-frit levemiljø. Disse levende dyr afleder dog kontinuerligt metabolsk affald til akvariet og sænker dermed vandkvaliteten. Filtre bruges til at fjerne giftigt affaldsmateriale og for at sikre optimale levekvilkår for akvariets indbyggere.
Protein-skimmere, som også kaldes skum-fraktioner, er filtre, der fjerner affaldsmateriale fra vandet, før det begynder at nedbrydes. Disse filtre består typisk af en lang reaktions-rør, hvorigennem meget fine bobler ledes. Boblerne skabes enten af en træ-sten, der er tilsluttet en vibrator-pumpe, eller af en venturi-funktion. Molekyler af fisk-urin og andre proteiner hæfter til boblerne og fjernes fra akvarium-vandet, når disse bobler danner stabilt skum på vandoverfladen. Dette skum presser op i en samlings-kop, som tømmes og rengøres efter behov.
Det porøse filter-materiale inden i disse filtre er dækket af kulturer af gavnlige bakterier. Ilt-elskede eller aerobe bakterie-arter udvikler sig på ydersiden af dette materiale, som er udsat for højt vandstrøm og ilt-niveauer. De arter af bakterier, der kun kan overleve i et ilt-arment miljø, vokser inde i det porøse filter-materiale. Sammen bryder disse bakterier det giftige metabolsk affald i akvarium-vandet ned.
Dette specialiserede filter består af en hul cylinder, der indeholder en ultraviolett-lyskilde. En-cellede alger, bakterier og sygdomsfremkaldende organismer, der båres i akvarium-vandet, ødelægges, når de passerer ultraviolett-pæren. Dette filter er derfor i stand til ikke kun at holde marin vand rent, men at kontrollere sygdoms-udbrud. Ultraviolette filtre bedst placeres efter det mekaniske filter, som fjerner større stykker detritus og affald, før vandet udsættes for ultraviolett-lyskilden.
Diatomæ-jord-filtre fjerner ekstremt små partikler af detritus fra akvarium-vandet. Diatomæ-jord er sammensat af diatomers skeletter og er i stand til at fange mikroskopiske partikler. Frit-svømmende patogener eller sygdomsfremkaldende organismer fjernes også fra akvarium-vandet af disse filtre. Diatom-filtre behøver ikke køre kontinuerligt og bruges normalt, når vandet er skyer, eller under et sygdoms-udbrud.
Kemisk filter-materiale fjerner giftstoffer fra akvarium-vandet. Aktiveret kul er det mest almindeligt brugte kemiske filter-materiale. Aktiveret kul fanger og holder moleklyler af affald, som fjernes fra akvariet, engang kullet affalds. Det er vigtigt at udskifte aktiveret kul på månedlig basis, for at forhindre det i at lække giftigt affald tilbage i akvarium-vandet.