Flodkaniner, også kendt som sumpkaniner, byttes af en række dyr, herunder:
- Pattedyr:
- Prærieulve: Disse er de mest almindelige rovdyr af flodkaniner.
- Breadkatte: Disse er også almindelige rovdyr, især i områder, hvor de overlapper med kaninens udbredelsesområde.
- Ræve: Både røde ræve og grå ræve kan jage flodkaniner.
- Vaskebjørne: Selvom de mest er altædende, vil vaskebjørne opportunistisk jage kaniner, især unge.
- Iltrer: Langbenede iltrer og kort-halede iltrer er kendt for at jage kaniner.
- Grävlinger: Amerikanske grävlinger er kraftige gravere og kan fange kaniner i deres huler.
- Tamhunde: Herreløse eller stikkede hunde kan udgøre en trussel mod flodkaniner.
- Fugle:
- Høge: Røde høge, Coopers høge og andre høge kan jage kaniner.
- Ugler: Store hornugler er kendt for at jage kaniner.
- Slanges: Større slanger som rotte slanger og sorte racer kan lejlighedsvis jage unge eller mindre flodkaniner.
- Andre:
- Alligatorer: I områder, hvor alligatorer er til stede, kan de være en betydelig rovdyr af flodkaniner.
De specifikke rovdyr, der er mest almindelige, vil afhænge af placeringen og levestedet, hvor flodkaninerne lever.