Ørken-bandikutens population er vanskelig at estimere på grund af dets skjulestedegart og udfordringerne ved at undersøge dets tørre, fjernliggende levested. Forskning og bevaringsindsatser viser:
- Levestedstab og fragmentering: Omvendelse af hummock-græsmarker og sandplain til landbrug, urbanisering og minedrift har alvorligt påvirket arten.
- Begrænset udbredelse: Fundes hovedsageligt i tørre områder i Western Australia og Northern Territory, hvilket gør den sårbar over for trusler.
- Rovdyr og konkurrence: Vilde katte og ræve prager på dem, mens kaniner og kameler konkurrerer om føde og ressourcer.
- Bevaringsindsatser: Beskyttede områeder, rovdyrkontrol, genopretning af levested og fællesskabsundervisning er i gang.
Populationsestimater varierer fra et par hundrede til flere tusind individer afhængigt af studieområde, men disse repræsenterer muligvis ikke hele udbredelsesområdet. Ørken-bandikuten er listet som "sårbar" af IUCN.
