Kæledyr
Kejserspingviner står over for naturlige rovdyr inklusive leopardæler, spækhuggere og kæmpepetreller, som kan dræbe voksne, unger og æg.
Klimaændringer er en af de største trusler. Efterhånden som Jorden varmes op, smelter havisen, som pingviner er afhængige af til yngel og fødesøgning, hvilket får dem til at miste deres hjem og fødekilder.
Fiskeri kan udtømme deres fødekilder, forurening kan forurene deres miljø, og turisme kan forstyrre ynglekolonier.
Indsatser inkluderer etablering af beskyttede områder, reduktion af fiskeri i pingviners levesteder, oprydning af forurening og oplysning af folk om vigtigheden af kejserspingviner.