Kæledyr
Klassificering af uddøde organismer fra fossile beviser er udfordrende af flere årsager:
Fossilregistret er ofte fragmentarisk på grund af knappe rester, tafonomiske processer og ujævn bevarelse. Dette gør det vanskeligt at forstå den fulde morfologi af uddøde arter.
Fossiler bevarer hovedsageligt hårde strukturer som knogler, tænder og skaller. Blødt væv såsom muskler, organer og hud fossiliserer sjældent, hvilket efterlader huller i viden om udseende og adfærd.
Processer efter døden – ådselædning, vejrforhold, transport og begravelse – kan forvrænge eller ødelægge vigtige anatomiske træk.
Konvergent evolution kan gøre ubeslægtede arter ens, hvilket forårsager fejlklassificering. Kryptiske arter med minimale morfologiske forskelle komplicerer også klassificering.
Fossiler giver ikke den genetiske information, der er nødvendig for moderne DNA-baseret taksonomi, hvilket begrænser klassificering til morfologiske sammenligninger.
Klassificeringer ændres med nye opdagelser og forskningsmetoder, hvilket betyder, at fossilt baserede klassificeringer kan blive forældede.
På trods af disse udfordringer bruger paleontologer sammenlignende anatomi, funktionel morfologi og fylogenetisk analyse til at klassificere uddøde organismer.