Flere faktorer kan begrænse synligheden af cellulære strukturer under mikroskopi:
- Opløsningsbegrænsninger: Nogle strukturer er for små til at kunne opløses.
- Prøveforberedelse: Fastgørelse, farvning og snitning kan introducere artefakter eller ændre strukturer.
- Farvningsteknikker: Ufarvede eller svagt farvede komponenter kan være usynlige.
- Begrænsninger ved billeddannelse: Belysning, kontrast og fokus påvirker billedkvaliteten.
- Skarphedsdybde: Strukturer uden for fokalsplanen ser slørede ud.
- Prøvens tykkelse: Liggende lag kan skjule dybere strukturer.
- Membranpermeabilitet: Nogle kompartimenter begrænser farveindtrængen.
- Cellulær dynamik: Forbigående komponenter er vanskelige at fange på et bestemt tidspunkt.
Avancerede teknikker som konfokal, superopløsning og elektronmikroskopi har forbedret evnen til at observere små cellulære komponenter.