Kæledyr
Frugtflagermus, eller flyvende ræve, har forskellige naturlige rovdyr afhængigt af art og sted.
* Høge, ugler og falke er kendt for at jage frugtflagermus.
* Tamme og herreløse katte, hunde, slanger og aber kan jage flagermus, især unge eller sårede.
* Krokodiller kan fange flagermus, der hviler nær vand.
* Store fisk som barracuda kan jage flagermus, der flyver over vand.
Jagt til føde eller medicin og tab af levesteder gennem skovrydning truer også frugtflagermus.
Specifikke rovdyr varierer efter geografisk placering, levested og byttedyrs tilgængelighed.